Sejumlah pengamat bersepekulasi KRI Nanggala-402 tenggelam karena kelebihan muatan. Sebelumnya, disebutkan KRI Nanggala-402 berkapasitas 40 personel.
Sementara, saat melakukan penyelaman KRI Nanggala-402 membawa 53 personel. Namun, hal itu dibantah oleh Asrenal Kasal Laksamana Muda TNI Muhammad Ali.